在職人員以研究生畢業(yè)同等學力申請碩士學位過程分兩階段：研究生課程進修班學習階段和碩士學位申請階段。
一、研究生課程進修班學習階段
學員入學后首先完成學籍注冊（學制8年）。在職人員以研究生畢業(yè)同等學力申請碩士學位學籍注冊分為兩類：科學學位和專業(yè)學位。已經取得《住院醫(yī)師規(guī)范化培訓第一階段合格證》的學員可自愿申請攻讀專業(yè)學位碩士，并注冊相應學籍；否則只能申請科學學位碩士，并注冊相應學籍。學員應將詳細的通訊方式（工作單位，通訊地址，家庭、科室、個人電話等）按要求上報學校，否則耽誤辦理學位申請手續(xù)后果自負。
研究生課程進修班學習階段一般要求學員半脫產學習一年，修滿規(guī)定的學分（26～2 8學分）。研究生進修班開設的課程都是在校研究生培養(yǎng)計劃所規(guī)定的課程，考勤及考試制度也等同于在校全日制碩士研究生。課程分學位課程和非學位課程（選修課）兩種類型，考試成績60分以上為合格。不合格的課程必須補考或重修，并繳納相應的補考費或重修費。
學員修滿規(guī)定的學分，即可完成研究生課程進修班學習。經審查合格后由醫(yī)學院研究生辦公室頒發(fā)《青島大學研究生課程進修班結業(yè)證書》。
需參加全國統(tǒng)考的學員及時登錄中國學位與研究生教育信息網（http://www.chinadegrees.cn），在職碩士欄目下同等學力申碩頁面進行注冊并填報個人基本信息和上傳電子照片，以便進行指紋信息采集工作。考試時間為每年5月底。若學員通過了相應的全國統(tǒng)考科目且研究生課程全部合格，應于當年9月份及時登錄“青島大學醫(yī)學院研究生網”查看“同等學力人員辦理學位注冊的通知”，按時辦理學位注冊手續(xù)。
二、碩士學位申請階段
學員獲得學士學位滿三年，通過研究生課程進修班所有課程考試并取得規(guī)定學分，且通過相應的全國外語和（或）綜合統(tǒng)一考試后，方可進入碩士學位申請階段。學位申請程序如下：
1、 學位注冊：每年9月中旬，醫(yī)學院研究生辦公室統(tǒng)一辦理學位注冊（外地班由教學點醫(yī)院科教科統(tǒng)一組織）。符合條件的學員名單屆時將公布在“青島大學醫(yī)學院研究生網”的“同等學力人員辦理學位注冊的通知”中，學員須按通知要求按時上交注冊材料：《青島大學同等學力申請碩士學位論文階段注冊登記表》（在青島大學醫(yī)學院研究生教育欄目，學籍學位處下載）一式三份（簽署單位、導師和學科意見后注冊始生效）。醫(yī)學院研究生辦公室同時接受科學學位轉專業(yè)學位學籍申請，學員屆時須已獲得《住院醫(yī)師規(guī)范化培訓第一階段合格證》，與每年8月底登錄“青島大學醫(yī)學院研究生教育”查看相關通知，并按時辦理手續(xù)，一般每年9月5日前辦理。
2、 分配導師：每年9月中旬，醫(yī)學院研究生辦公室安排各學科點開展導師分配工作（雙向選擇，學科統(tǒng)一安排），同時標志學員正式進入學科點（教研室）。學員應根據當年通知要求，在規(guī)定期限內盡早主動與學科聯(lián)系，并應及時向學科交納肆仟元課題經費，服從學科及導師的安排統(tǒng)一開展課題。學員可登錄“青島大學研究生處”網站查看“導師風采”欄目提前了解各學科導師信息。
3、 開題：學員在9月中旬分配導師后，應及時與導師聯(lián)系，確定研究方向和課題名稱，查詢資料和進行預實驗。11月中旬，醫(yī)研辦發(fā)布開題報告通知，學員在學科和導師的安排下進行開題答辯，每年12月27日前以學科為單位上交如下材料：①《青島大學碩士學位論文開題報告》（一式兩份，書面版+電子版）②綜述（一份，不少于8000字，書面版+電子版）③開題幻燈（電子版）。開題報告和綜述的模板可聯(lián)系各學科教學秘書獲取）。
4、 專業(yè)考核：專業(yè)考核與開題報告同一時間段舉行。專業(yè)課（5學分）和專業(yè)外語（1學分）的學習和考核由學科統(tǒng)一組織命題考核，不允許單考，成績單（學科負責人簽字、蓋章）和試卷與開題報告一起上交。
5、 中期篩選：開題一學期后（一般為6月底）進行中期篩選。《中期篩選表》每年7月7號前由學科統(tǒng)一上交（書面版和電子版，模板在各科教學秘書處）。
6、 發(fā)表文章著作：科學學位碩士申請者要求在學期間在正式刊物上至少以第一作者且青島大學為第一作者單位在正式刊物上發(fā)表1篇與本人研究方向相關的學術論文。本學科研究生培養(yǎng)方案中相關規(guī)定高于此項要求的，按培養(yǎng)方案規(guī)定要求執(zhí)行。文獻綜述和論文摘要不計其內。提前申請學位論文答辯者要求在上述條件基礎上增加一篇。專業(yè)碩士學位申請者一般不要求發(fā)表文章，學科對專業(yè)碩士學位申請者高于此要求的須按照學科要求發(fā)表文章。
7、 臨床能力考核： 申請專業(yè)學位的學員在申請學位前需通過臨床能力考核，考核一般安排在每年11月份，每年一次，未通過者不能申請學位。
8、 申請碩士學位：開題滿一年的學員方可提出學位申請。學員須在答辯前3個月（每年3月初和9月初）正式提出申請，屆時須完成碩士學位論文，同發(fā)表文章的原件、復印件和實驗記錄本一起交至學科點（教研室），由學科點（教研室）和研究生辦公室審核后確定申請學位人員名單，并參加論文盲評抽檢。抽檢到的人員由青島大學學位辦組織論文盲評，盲評時有一位評閱人評分不到75分者，學位申請人本次申請無效。未盲評抽檢的學員須參加由醫(yī)學院研究生辦公室組織學科點（教研室）統(tǒng)一進行的學位論文評閱，論文評閱中若有一位評閱人的評語屬于否定，學位申請人本次申請無效。論文評閱人要求至少三位，必須全部是外單位相應專業(yè)副高以上專家（外單位是指本校和申請人工作單位以外，詳見當年大學規(guī)定）。論文評閱人應是責任心強，學風正派，在這一學科領域學術造詣較深，近年來在科學研究中頗有成績的副高以上專家。論文評閱工作應在答辯工作開始前結束，評閱工作將逐步實現(xiàn)“雙盲”。
評閱科學學位碩士學位論文參考以下幾方面進行：
①究成果的理論意義和使用價值，有創(chuàng)新的明確指出創(chuàng)新之處；②論據是否充分、可靠；
③掌握基礎理論、專門知識、研究方法和技能的水平；④論文寫作水平；⑤指出該論文的不足之處。
臨床醫(yī)學碩士專業(yè)學位論文的要求：
①學位論文可以是病歷分析報告或文獻綜述； ②學位論文應緊密結合臨床實際，以總結臨床實踐經驗為主；③學位論文應表明申請人已經掌握臨床科學研究的基本方法。
評閱人應對論文是否達到與申請學位相應的學術水平以及可否提交答辯提出明確意見。評閱意見最遲應于答辯前十天送交研究生辦公室。
9、論文答辯：論文答辯每年組織兩次，上半年答辯時間為每年5月底～6月初，下半年答辯時間為每年11月底～12月初。所有學員答辯前必須參加青島大學學位辦組織的盲評抽檢，盲評與論文評閱通過后，方可參加論文答辯。碩士學位論文答辯會一般由五名教授、副教授或相當職稱的專家組成，委員中應至少有一名是外單位的專家。答辯委員會設秘書一人（講師或講師以上職稱）。碩士論文答辯委員會成員名單由學科點推薦，研究生辦公室和院學位評定分委員會審查批準。參加答辯研究生的指導教師不得成為答辯委員會成員，但在答辯時可以列席，在討論表決及形成決議時即應離席回避。
若論文答辯未通過，本次申請無效。若論文答辯雖未通過，但論文答辯委員會建議修改論文后再重新答辯者，可在半年后至一年內重新答辯一次，答辯仍未通過或逾期未申請者，本次學位申請無效。
10、授予學位：申請人通過同等學力水平認定，經院學位評定分委員會同意，報校學位評定委員會批準，授予碩士學位并頒發(fā)學位證書，時間一般為每年7月初和1月初。